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11月10日_研究人员分析宿主基因对COVID-19严重程度和易感性的影响

编译者:zhangmin发布时间:Nov 18, 2020点击量:46479 来源栏目:机理研究

11月10日,深圳市第三人民医院等在Cell Discovery期刊发表题为“Initial whole-genome sequencing and analysis of the host genetic contribution to COVID-19 severity and susceptibility”的文章。研究人员初步分析了宿主基因对COVID-19严重程度和易感性的影响。

文章称,该研究通过对深圳第三人民医院不同严重程度分类的332例COVID-19患者进行深入测序和分析,首次在中国人群中进行宿主基因研究。该团队在校正了潜在的混杂因素之后,在总共2220万个遗传变异中,对五个严重程度组(包括无症状、轻度、中度、重度和重症患者)进行了单变量和基于基因的关联测试。谱系分析表明,对于危重病和无症状疾病,GOLGA3和DPP7中功能变异的丧失可能具有单基因效应。全基因组关联研究表明,与严重性相关的最重要基因位点位于参与IL-1信号通路的TMEM189–UBE2V1中。与轻度和普通人群相比,重症患者中影响TMPRSS2蛋白稳定性的p.Val197Met错义变体显示等位基因频率降低。该研究确定,HLA-A* 11:01,B* 51:01和C* 14:02等位基因明显诱发了患者的最坏结果。这项对中国患者的初步基因组研究为COVID-19患者群体的表型差异提供了遗传学方面的见解,并着重指出了可能有助于指导有针对性控制疫情的基因和变异。该文章还回顾了该研究的局限性和优点,以指导今后国际上阐明COVID-19和其他传染性和复杂疾病宿主-病原体相互作用的遗传结构的工作。

原文链接:https://www.nature.com/articles/s41421-020-00231-4

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