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5月8日_南京农业大学等团队通过比较分析SARS-CoV-2与人、宠物、家畜及可能的中间宿主的ACE2和ACE2受体结合蛋白为SARS-CoV-2动物来源提供线索

编译者:xuwenwhlib发布时间:May 10, 2020点击量:6190 来源栏目:病毒溯源

信息名称:南京农业大学等团队通过比较分析SARS-CoV-2与人、宠物、家畜及可能的中间宿主的ACE2和ACE2受体结合蛋白为SARS-CoV-2动物来源提供线索

1.时间:2020年5月8日

2.机构或团队:南京农业大学、军事医学科学院军事兽医研究所、德国柏林自由大学

3.事件概要:

5月8日,bioRxiv发表了题为“Comparison of SARS-CoV-2 spike protein binding to human, pet, farm animals, and putative intermediate hosts ACE2 and ACE2 receptors”的文章。

本文中作者利用最近发布的与SARS-CoV-2棘突蛋白受体结合域(RBD)结合的人ACE2的X射线结构,以预测SARS-CoV-2棘突蛋白RBD与不同动物(包括宠物、家畜和SARS-CoV-2可能的中间宿主)ACE2蛋白的结合。通过比较已知受体的ACE2蛋白与不是受体蛋白的相互作用位点的差异,可以确定那些对结合很重要的残基。研究发现,ACE2中与棘突蛋白接触的20个氨基酸中,有7个可以被替换后ACE2仍然可以作为SARS-CoV-2受体发挥作用。这些可变氨基酸主要集中聚集在结合位点的外围,而不变残基的变化则阻止了相应动物中的刺突蛋白结合或感染。一些ACE2蛋白甚至能耐受刺突蛋白界面附近的N-糖基化位点的丢失或获得突变。值得注意的是,猪和狗分别未被或未被有效感染,其结合部位只有少量变化,在呼吸道中的ACE2水平相对较低。通过比较来自蝙蝠和穿山甲中的SARS-CoV-2刺突蛋白的RBD表明,穿山甲病毒只含有一种替代突变,而蝙蝠病毒只有五种。然而,穿山甲的ACE2与人的ACE2相比有七个变化,蝙蝠、浣熊(raccoon)和麝猫(civet)的ACE2中也存在类似数量的替代突变,这表明SARS-CoV-2可能并不是完全适应其任何可能的中间宿主的ACE2。本文相关分析为SARS-COV-2受体的利用和动物来源提供了新的线索。

*注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。

4.附件:

原文链接

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.05.08.084061v1

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