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2018年12月11日，美国疾病预防控制中心、英国科学与创新网络和威康信托基金会联合发布《解决环境中抗生素耐药性问题的举措》（Initiatives for Addressing Antimicrobial Resistance in the Environment）报告，确定了在解决环境中的抗生素耐药性问题方面存在的知识差距。

报告指出，抗生素和耐药微生物存在于环境中，并可通过水源和土壤扩散。这种环境污染的主要来源是来自家庭和医院的人类废物、来自农场的动物废物、制药废物和用于农业的抗菌杀虫剂等。虽然近年来一些研究已经确定了农业土壤、河流和湖泊沉积物、潮汐河口及污水处理设施中的抗生素、耐药生物和耐药基因，但报告指出这种污染的规模和风险及对人类健康的影响均尚未完全了解。