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编译服务: COVID-19科研动态监测 编译者: xuwenwhlib 编译时间: 2020-6-19 点击量: 16

信息名称:韩国基础科学研究所等团队优化了基于PCR和实时PCR方法的SARS-CoV-2引物组合及检测方案

1.时间:2020年6月16日

2.机构或团队:韩国基础科学研究所、韩国先进科技学院、韩国首尔国立大学盆唐医院

3.事件概要:

6月16日,Experimental & Molecular Medicine发表了题为“Optimization of primer sets and detection protocols for SARS-CoV-2 of coronavirus disease 2019 (COVID-19) using PCR and real-time PCR”的文章。

SARS-CoV-2具有很强的传染性,在全球范围内迅速传播。并且,由于COVID-19各种症状以及无症状病例传播的可能性,迫切需要一种快速、灵敏的检测方案来诊断无症状人群。目前许多公司和国家卫生机构已经提供了各种SARS-CoV-2诊断试剂盒。然而,缺乏关于这些诊断试剂盒的公开信息。针对日益增长的需求和信息缺乏,本文研究团队在前期的研究中开发并提供了一种低成本、易获取、实时的基于PCR的病毒早期检测方案。在检测方案的制定过程中,研究者发现未优化的引物组合可能会无意中显示假阳性结果,从而增加了商用诊断试剂盒产生假阳性结果的可能性。

因此,在本文中,研究团队为特定引物组合的设计和优化提供了三步指南步骤:(1)选择SARS-CoV-2靶基因(RdRP、N、E和S)引物组合;(2)对引物和扩增子序列进行silico分析验证;(3)优化PCR条件(如引物浓度和退火温度)以利于引物和目标基因之间的特异性杂交,以及消除假引物二聚体。此外,研究者将先前开发的基于实时PCR的检测方案扩展到更传统的基于PCR的方案,并应用了基于多重PCR的方案,使该检测方案指南可允许同时检测RdRP、N、E和S的引物组合。本文最新优化的检测方案将有助于大规模、高保真地筛查无症状人群,即使没有任何高规格的设备,也有助于进一步预防病毒传播,实现早期干预和治疗。

4.附件:

原文链接

https://www.nature.com/articles/s12276-020-0452-7

 

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