撰文 | SLS 不论在真核细胞还是细菌中,RNA聚合 酶II (RNA Pol II) 在转录过程中能够发生 回溯 (backtracking) ,这一过程参与基因表达水平的调控和DNA修复。Pol II的回溯导致部分新转录出的RNA 3‘端从Pol II伸出,这一部分能够被转录因子IIS (TFIIS) 切割从而恢复正常的转录。TFIIS切割的效率和时间的不同会导致短暂的转录暂停或者长时间的转录停滞。为了表征整个基因组中回溯的情况,研究者曾利用mNET-seq通过比较野生型和TFIIS失活的细胞中新转录出的RNA位点,发现了回溯发生的基因和位点。然而该方法依赖内源TFIIS活性,只能灵敏地检测短暂的Pol II回溯,而无法检测持久的Pol II回溯。 近日,纽约大学 (NYU) 的Evgeny Nudler课题组在Molecular Cell期刊上在线发表了题为 Persistence of backtracking by human RNA polymerase II 的文章,研究者 开发了一套新的测序方法(LORAX-seq),系统地探究Pol II持久回溯的情况,揭示了Pol...